Σύμφωνα με την προκήρυξη της ΕΣΚΑΘ, μετά το τέλος της πρώτης φάσης θα ακολουθήσει η Β΄ φάση για την ανάδειξη του πρωταθλητή Θεσσαλίας.
Έτσι στην τελική τετράδα προκρίνονται οι δύο πρώτες ομάδες από τον Α’ Όμιλο που είναι ο Αιολικός και η Ανόρθωση(ακόμα και με ήττα στον τελευταίο αγώνα) και Β’ Όμιλο που είναι Αετοί Λάρισας και Απόλλων Καρδίτσας και θα διασταυρωθούν στα ημιτελικά χιαστί (ο α΄ του πρώτου ομίλου με τον β΄ του δευτέρου ομίλου και ο α΄ του δευτέρου ομίλου με τον β΄ του πρώτου ομίλου).
Οι αγώνες θα διεξαχθούν εναλλάξ στην έδρα της κάθε ομάδας, ενώ πλεονέκτημα έδρας θα έχουν οι ομάδες που τερμάτισαν στην α’ θέση της κανονικής διάρκειας κάθε ομίλου. Νικήτρια ομάδα θα αναδειχθεί η ομάδα που θα φτάσει πρώτη στις δύο νίκες.
Β΄Φάση Ημιτελικοί
1ος αγώνας
Αιολικός - Απόλλων Καρδίτσας (1)
Αετοί - Ανόρθωση (2)
2ος αγώνας
Απόλλων Καρδίτσας - Αιολικός (1)
Ανόρθωση - Αετοί (2)
3ος αγώνας (εάν χρειαστεί)
Αιολικός - Απόλλων Καρδίτσας (1)
Αετοί - Ανόρθωση(2)
Τελικός
Νικητής (1) - Νικητής (2) 